Risk of BA.5 Infection among Persons Exposed to Previous SARS-CoV-2 Variants | NEJM

Risk of BA.5 Infection among Persons Exposed to Previous SARS-CoV-2 Variants | NEJM

A l’éditeur :

Au cours des derniers mois, omicron (B.1.1.529) est devenu la variante dominante du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), montrant un certain degré d’évasion immunitaire.1 Les sous-variantes initiales de l’omicron, BA.1 et BA.2, sont progressivement remplacées par BA.5 dans de nombreux pays, probablement en raison d’une transmissibilité accrue et d’une évasion partielle de l’immunité induite par BA.1 et BA.2.23 La protection fournie par BA.1 contre l’infection par le sous-variant BA.5 est critique car les vaccins adaptés dans les essais cliniques sont basés sur BA.1.

Le Portugal a été l’un des premiers pays touchés par une domination BA.5. Nous avons utilisé le registre national des maladies à coronavirus 2019 (Covid-19) (SINAVE) pour estimer le risque d’infection par BA.5 chez les personnes ayant une infection documentée avec des variantes passées, y compris BA.1 et BA.2. Le registre comprend tous les cas signalés dans le pays, quelle que soit leur présentation clinique.

Effet protecteur d’une infection antérieure par le SRAS-CoV-2 sur l’infection par le sous-variant Omicron BA.5.

Comme le montre le panneau A, nous avons identifié les périodes (de différentes couleurs) au cours desquelles un variant était représenté dans plus de 90 % des isolats (données du syndrome respiratoire aigu sévère national coronavirus 2 [SARS-CoV-2] surveillance de la diversité génétique4). Les périodes grises représentent les moments où plus d’une variante était en circulation. Compte tenu de la transition relativement lente entre la dominance de la sous-variante omicron BA.1 et la dominance de la sous-variante omicron BA.2, nous avons regroupé BA.1 et BA.2 dans l’analyse. Nous n’avons inclus aucune personne infectée dans les 90 jours précédant la dominance de la sous-variante omicron BA.5. Le panneau B montre l’efficacité de la protection contre l’infection pendant la période de dominance BA.5 (à partir du 1er juin 2022) chez les personnes atteintes d’une infection aux périodes de dominance de différentes variantes, comme illustré dans le panneau A., par rapport aux personnes sans aucune infection documentée . Jusqu’au 1er juin. Les personnes atteintes de deux infections avant le 1er juin n’ont pas été incluses dans l’étude. Les barres représentent les intervalles de confiance à 95 %.

La surveillance génétique nationale du SRAS-CoV-2 a identifié des périodes au cours desquelles différents variants représentaient plus de 90 % des isolats.4 Nous avons identifié toutes les personnes ayant eu une première infection en période de dominance de chaque variant, pour calculer leur risque d’infection pendant la période de dominance BA.5 (Figure 1A). Nous avons combiné BA.1 et BA.2 en raison de la transition lente entre les deux sous-variantes dans la population. Enfin, nous avons calculé le risque d’infection par BA.5 pour la population qui n’avait aucune infection documentée avant la dominance de BA.5 (1er juin 2022).

Nous avons constaté qu’une infection antérieure par le SRAS-CoV-2 avait un effet protecteur contre l’infection par BA.5 (Figure 1B et tableau S1 dans l’annexe supplémentaire, disponible avec le texte intégral de cette lettre sur NEJM.org), et cette protection était la plus élevée pour les infections antérieures par BA.1 ou BA.2. Ces données doivent être considérées dans le contexte d’infections épidémiques dans une population hautement vaccinée, étant donné qu’au Portugal, plus de 98 % de la population étudiée ont terminé la primovaccination avant 2022.

La conception de l’étude ne peut pas éliminer tous les facteurs de confusion (voir la section Discussion dans l’annexe supplémentaire). De plus, une limitation est l’effet putatif d’abaisser l’immunité dans une population avec une immunité hybride (infection et vaccination antérieures). Nous avons constaté que l’infection par BA.1 ou BA.2 chez les personnes vaccinées offrait une meilleure protection contre BA.5 que l’infection par des variants pré-omicron, conformément à un rapport récent avec une conception de test négative.5 Cependant, les infections BA.1 ou BA.2 se sont produites plus près de la période de dominance BA.5 que les infections avec des variantes antérieures. Il existe une perception selon laquelle la protection contre une infection antérieure par BA.1 ou BA.2 est très faible, étant donné le nombre élevé d’infections par BA.5 parmi les personnes ayant une infection antérieure par BA.1 ou BA.2. Nos données indiquent que cette perception est probablement une conséquence du plus grand groupe de personnes infectées par BA.1 ou BA.2 que celles infectées par d’autres sous-variantes, et n’est pas étayée par les données.

Dans l’ensemble, nous avons constaté que les percées d’infections par le sous-variant BA.5 étaient moins probables chez les personnes ayant des antécédents d’infection par le SRAS-CoV-2 dans une population hautement vaccinée, en particulier pour les infections antérieures à BA.1 ou BA.2, que chez les personnes ayant des antécédents d’infection par le SRAS-CoV-2. un antécédent d’infection par le SARS-CoV-2 personnes non infectées. .

João Malato, M.Sc.
Institut de médecine moléculaire João Lobo Antunes, Lisbonne, Portugal

Ruy M. Ribeiro, D. Phil.
Laboratoire national de Los Alamos, Los Alamos, Nouveau-Mexique

Dr Pedro P. Leite
Dr Pedro Casaca
Eugenia Fernandes, Ph.D.
Direction générale de la santé, Lisbonne, Portugal

Carlos Antunes, Ph.D.
Université de Lisbonne, Lisbonne, Portugal

Valter R. Fonseca, MD, Ph.D.
Direction générale de la santé, Lisbonne, Portugal

Manuel C. Gomes, Ph.D.
Université de Lisbonne, Lisbonne, Portugal

Luis Graca, MD, D.Phil.
Institut de médecine moléculaire João Lobo Antunes, Lisbonne, Portugal
[email protected]

Soutenu par l’Union européenne horizon 2020 programme de recherche et d’innovation (numéro de projet ERA, 952377–iSTARS) et par Fondation pour la science et la technologie par 081_596653860 et PTDC/MAT-APL/31602/2017 et par Instituts nationaux de la santé subvention R01-AI116868.

Les formulaires de divulgation fournis par les auteurs sont disponibles avec le texte intégral de cette lettre sur NEJM.org.

Cette lettre a été publiée le 31 août 2022 sur NEJM.org.

Drs. Gomes et Graça ont également contribué à cette lettre.

  1. 1. quel Q, pharaon j, jp evans, et coll. Neutralisation des sous-variants du SARS-CoV-2 omicron BA.4/5 et BA.2.12.1. N Anglais J Med 2022;386 :25262528.

  2. deux. tu j, Collier AY, Rowe M, et coll. Neutralisation des variantes SARS-CoV-2 omicron BA.1 et BA.2. N Anglais J Med 2022;386 :15791580.

  3. 3. cao et, Yisimayi A, Jian F., et coll. BA.2.12.1, BA.4 et BA.5 échappent aux anticorps produits par une infection par omicron. La nature 2022;608 :593602.

  4. Quatre. Institut national de la santé Douteur Ricardo Jorge. Diversité génétique du nouveau coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19) au Portugal. (En portugais) 2022 (https://insaflu.insa.pt/covid19).

  5. 5. Altarawneh HN, Chemaitelly H, Ayoub HH, et coll. Protection de l’infection naturelle par le SRAS-CoV-2 contre la réinfection par les sous-variants omicron BA.4 ou BA.5. Juillet 12, 2022 (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.07.11.22277448v1). prépresse

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