Lorsque l’industrie pharmaceutique s’est précipitée pour développer les premiers vaccins COVID en 2020, il était logique que les développeurs se concentrent sur la partie du virus qui lui permet de s’accrocher et d’infecter nos cellules : les protéines de pointe.
Les meilleurs vaccins contiennent une partie du pic, ou des données génétiques sur le pic, dont chacun peut stimuler une réponse immunitaire. Pour ne pas être en reste, le virus a muté, de nombreux changements se produisant à ce pic.
Mais d’autres parties du virus changent également. Maintenant, pour la première fois, une équipe de scientifiques a analysé ces changements et a émis un avertissement.
“Avec chaque variante majeure qui a été identifiée, nous voyons des mutations en dehors de [the] pic que nous essayons de comprendre », a déclaré Matthew Frieman, immunologiste et microbiologiste à la faculté de médecine de l’Université du Maryland et auteur principal de la nouvelle étude, au Daily Beast.
Il est possible que le virus accumule des mutations sans pointes dans le but d’obtenir un avantage sur notre immunité collective alors que la pandémie de COVID entre dans sa quatrième année. Ces nouvelles mutations peuvent ne pas rendre le virus plus infectieux comme le font les mutations de pointe, mais elles pourraient être associées à plus vaste infections
Si cette tendance se poursuit, et il n’y a aucune raison de croire que ce ne sera pas le cas, nous pourrions éventuellement avoir besoin de nouveaux médicaments antiviraux et de nouvelles formulations de vaccins qui ne ciblent pas aussi spécifiquement le pic.
Les développeurs de vaccins n’ont pas eu tort de concentrer leurs efforts initiaux sur la protéine de pointe, ont expliqué Frieman et ses co-auteurs dans leur étude évaluée par des pairs, publiée dans Actes de l’Académie nationale des sciences et est apparu en ligne mardi. “La protéine de pointe est l’antigène immunodominant”, ont-ils écrit. En d’autres termes, c’est la partie du virus la plus susceptible de produire une forte réponse immunitaire.
De plus, les principales variantes et sous-variantes du SARS-CoV-2 (Delta puis les différentes formes d’Omicron, dont BA.4 et BA.5) ont accumulé des mutations de pointe. Au fur et à mesure que le pic évolue, le virus s’accroche de mieux en mieux à nos cellules malgré la présence d’anticorps.
C’est l’une des raisons pour lesquelles les vaccins sont devenus un peu moins efficaces, et nous voyons de plus en plus de cas de percées chez les personnes vaccinées. Et il n’est pas surprenant que l’un des principaux prétendants à la prochaine sous-variante dominante, un dérivé d’Omicron appelé BA.4.6, présente une mutation de pointe particulièrement inquiétante appelée R346T.
Mais il y a eu des signes que les mutations sans pointe deviennent également un facteur plus important. Les généticiens ont noté que BA.5, actuellement la sous-variante dominante, a non seulement des mutations le long de sa pointe, mais change tout au long de sa structure.
Frieman a expliqué qu’il devait y avoir une raison à ces mutations. “Les virus ne font pas les choses par accident.” Au lieu de cela, ils essaient de petits changements, encore et encore, jusqu’à ce qu’une combinaison de changements l’aide à survivre et à se propager. La variante ou la sous-variante résultante surpasse alors les autres formes de l’agent pathogène jusqu’à ce qu’elle devienne dominante, et la base probable de la prochaine ensemble de mutations.
Pour comprendre la raison et les effets des mutations sans pointe, l’équipe de Frieman a cloné le SRAS-CoV-2, puis a commencé à éliminer les protéines de pointe et à tester les “virus knock-out” résultants chez la souris, en évaluant à quel point les virus étaient contagieux et à quel point ils étaient graves. . les infections étaient.
Sa conclusion ? “Les mutations de [the] le pic peut être à l’origine de phénotypes critiques d’infection et de maladie par le SRAS-CoV-2. Autrement dit, les changements au-delà du pic commencent à définir le virus.
Pour l’instant, il semble que les mutations avec et sans pointe fonctionnent ensemble. Les mutations de pointe rendent le virus de plus en plus contagieux. “Les mutations dans [the] Des pointes ont été identifiées dans toutes les variantes majeures qui surpassent ensuite la variante précédente », a expliqué Frieman.
Pendant ce temps, les mutations sans pointe semblent prolonger l’infection. Ceci, à son tour, donne à l’agent pathogène plus de temps pour muter au sein d’une personne particulière et également pour se propager à d’autres personnes. “Nous émettons l’hypothèse que cet équilibre est essentiel pour la poursuite de l’évolution du SRAS-CoV-2”, a écrit l’équipe de Frieman.
Alors que le virus continue de tester des mutations pour devancer notre immunité axée sur les pics, il pourrait encore accentuer les changements au-delà du pic. BA.5, avec son large éventail de mutations, est un signe que cela se produit déjà.
Considérez cela comme un appel urgent à une étude plus approfondie des mutations sans pointe. “Au fur et à mesure que de nouvelles variantes émergeront, nous identifierons des mutations supplémentaires en dehors de [the] pic qui contribue de manière significative à la réplication, à la transmission et à la pathogenèse virales », ont écrit Frieman et ses coauteurs.
Frieman a déclaré que son objectif était d’examiner ces mutations sans pointes pour “découvrir ce qu’elles font, comment elles le font”. [and] pourquoi ils rendent le virus meilleur pour être un virus. “Ensuite, nous pouvons utiliser ces informations pour fabriquer des médicaments”, y compris de nouvelles thérapies antivirales et des formulations de vaccins.
La vitesse compte. La variante Omicron et ses sous-variantes à tir rapide, chacune apparaissant quelques mois seulement après la dernière, étaient un avertissement que nos processus de recherche et de développement pharmaceutiques pourraient être trop lents. Notez que la Food and Drug Administration des États-Unis a donné la semaine dernière son feu vert aux rappels de vaccins spécifiques à Omicron, 10 mois après que la variante initiale d’Omicron est devenue courante. “Omicron et ses lignées”, un autre terme pour les sous-variantes, “nous ont appris une leçon sur la nécessité d’être plus agiles dans la modification du vaccin”, a déclaré Ali Mokdad, professeur de sciences de la métrique de la santé à l’Institute of Health de l’Université de Washington, au Washington Post. bête du quotidien.
Ce problème pourrait s’aggraver si le taux de mutations sans pointe est accéléré. Notre recherche et développement de vaccins est trop lent, même lorsqu’il est étroitement concentré sur le pic. Que se passe-t-il lorsque vous devez étendre votre portée pour combattre un virus qui apprend à muter dans sa structure ?
Il y a une autre ride. Ces mutations accumulées dans le nouveau coronavirus, au pic et Non à son apogée, il pourrait commencer à interférer avec les tests de réaction en chaîne par polymérase que nous utilisons pour détecter et suivre le virus.
Les tests PCR et le séquençage utilisent des amorces adaptées à une certaine gamme de caractéristiques virales. Trop de mutations “peuvent gâcher le test PCR”, a déclaré Niema Moshiri, généticienne à l’Université de Californie à San Diego, au Daily Beast.
Faites attention, mais ne paniquez pas. Il n’est vraiment pas surprenant que le SRAS-CoV-2 teste des mutations dans différentes parties du virus. C’est ce que font les virus : s’adapter. L’astuce pour nous, hôte du nouveau coronavirus, est de nous adapter au moins aussi vite.
Nous l’avons déjà fait en développant rapidement des vaccins et des thérapies qui ciblent la partie la plus dangereuse du virus. Nous pouvons le faire à nouveau car le virus trouve de nouvelles façons d’évoluer. Tout ce dont vous avez besoin, c’est de volonté politique… et d’argent.